Род насчитывает около 30 видов. Перец - это многолетние кустарники или полукустарники, высотой более 2 м. Листья от продолговатоовальных до яйцевидных до 30 см в длину, очередные, простые, цельнокрайние, гладкие. Цветки пазушные, одиночные или собраны в пучки, простые, звездчатые, белые с различными оттенками (желтыми, зелеными, фиолетовыми). Плод - многосемянная ягода, различаются по цвету, форме и размеру.
Перец стручковый, овощной (Capsicum annuum) - многолетнее ветвистое растение высотой до 1,5 м, в культуре выращивается как однолетнее. Листья конические, до 25 см в длину, одиночные или собраны в пучки, зеленые. Цветки крупные, одиночные или собраны в пучки, белые, иногда с фиолетовыми полосками. Плоды зеленого, желтого, оранжевого и красного цветов, различаются по форме и размеру. Этот вид многообразен различными сортами, которые имеют сладкие или жгучие плоды.
Перец ягодный, ягодоносный (Capsicum baccatum) - высотой до 2 м. Листья длиной до 30 см, темно-зеленые. Цветки, как правило одиночные, бело-зеленые с желтоватыми, зеленоватыми или коричневыми пятнами. Плоды бывают желтого, оранжево-красного и даже коричневого цветов, сильно различаются по форме (могут быть маленьких округлых форм или длинных заостренных). Вначале растут вертикально, потом по мере роста опускаются. Жгучий вид.
Перец китайский или Хабанеро (Capsicum chinense) - высотой до 50 см. Листья яйцевидной формы, светло-зеленые, морщинистые. Цветки маленькие, зеленовато-белые, одиночные или собразы в пучки. Плоды различаются по форме и цвету (желтые, оранжевые, красные, даже выведены сорта с белыми, розовыми и коричневыми плодами). Один из самых жгучих перцев.
Перец кайенский, острый (Capsicum frutescens)
- высотой до 2 м. Обычно двухлетний, но может прожить и дольше. Листья до 20 см длиной, овальной или эллиптической формы. Цветки одиночные, бело-зеленые. Плоды длиной от 2 до 5 см, вертикальные, острые, белые, желтые, ярко-красные, фолетовые и даже черные. Жгучий перец.
Перец опушенный (Capsicum pubescens) - многолетний кустарник (иногда выращивают как вьющееся растение) может достигать высоты до 4 м. Побеги опушенные, с возрастом одревесневают. Листья длиной до 12 см, яйцевидные сужающиеся к концу и основанию, опушенные. Цветки одиночные или парные, фиолетового цвета. Плоды короткие, тупоконечные, желтого, оранжевого, темно-красного и даже коричневого цветов, иногда окрашиваются в черный, не успев вызреть. Жгучий перец.